В начале своей истории университет носил название “Академия Цюши ”. Он был основан в 1897 году и явился первенцем западного прообраза высшей школы в новейшей истории Китая. Начиная с 1901 года, университет неоднократно переименовывался и даже однажды закрывался. В 1927 году на старом месте университета был создан третий университет им. Сунь Ятсена (после преобразования Чжэцзянского городского политехнического колледжа и Чжэцзянского городского сельскохозяйственного колледжа в политехнический институт третьего университета им.Сунь Ятсена и рабоче-крестьянский институт. С 1 апреля 1928 года он стал носить название Чжэцзянский университет, а с 1 июля 1928 г. к названию добавилось слово “государственный” и появилось его новое название Чжэцзянский государственный университет, в составе которого работали три колледжа – Политехнический, Сельскохозяйственный, Гуманитарный.

После начала японского вторжения в Китай университет был вынужден переехать на запад страны – в Гуйчжоу. Под руководством его ректора, известного в Китае метеоролога и географа Чжу Кэчжэнь, университет, пройдя через ряд невзгод и трудностей, превратился в один из авторитетнейших вузов Китая. В этой связи известный британский ученый Джозеф Нидхэм высоко оценил деятельность университета, назвав его “Восточный Кэмбридж”. Осенью 1946 года университет вернулся в г.Ханчжоу. И к концу марта 1948 г. университет превратился в классический вуз с семью институтами – Гуманитарный, Естественный, Политехнический, Сельскохозяйственный, Педагогический, Юридический, Медицинский, с 25 факультетами, с 9 НИС и одной лабораторией.

В 1952 году все вузы КНР подверглись реструктуризации. В том числе это сильно коснулось и Чжэцзянского университета. Некоторые его подразделения и факультеты объединились со сходными по направлениям вузами, находящимися за пределами провинции Чжэцзян, а некоторые – создали отдельно самостоятельные вузы, или же, слившись с Чжэцзянским университетом и Чжэцзянским медицинским колледжом, вновь создали новый университет.

История Чжэцзянского университета – одного из старейших вузов Китая берет свое начало с 1897 года – времени основания Института Юйин и Чжэцзянского провинциального медицинского института, который был основан в 1912 году и носил название Чжэцзянский медицинский колледж. В результате объединения Института литературы Чжэцзянского университета, отдельных подразделений Технического института, Академии искусств и наук Чжицзянского университета и Чжэцзянского педагогического колледжа был создан Чжэцзянский педагогический институт. В 1958 году был создан Ханчжоуский университет после объединения Чжэцзянского университета с обновленным Ханчжоуским университетом. В это же время Сельскохозяйственный институт выходит из состава Чжэцзянского университета и с 1960 года называется Чжэцзянский сельскохозяйственный университет. Медицинский институт Чжэцзянского университета объединяется с Медицинским Чжэцзянским провинциальным медицинским институтом и создается Чжэцзянский медицинский институт, который в 1960 году переименовывается в Чжэцзянский медицинский университет. После проведенной реструктуризации Чжэцзянский университет преобразуется в многопрофильный политехнический университет.

За минувший почти 50-ти летний период развития, особенно в период политики реформ и открытости, Чжэцзянский университет, пройдя основные этапы своего становления – Чжэцзянский университет, Ханчжоуский университет, Чжэцзянский сельскохозяйственный университет, Чжэцзянский медицинский университет, добился славных успехов. Университет приобрёл широкую мировую славу и стал одним из ведущих центральных вузов КНР, объединив естественные, технические и гуманитарные науки при центральной роли современных технологий. В 1995 году университет включен в список ведущих университетов КНР, принимающих участие в реализации программы «Проект 211». Ханчжоуский университет, Чжэцзянский сельскохозяйственный университет, Чжэцзянский медицинский университет в истории становления нынешнего Чжэцзянского университета сыграли важную роль для создания уникального вуза, укрепления его мощи, поднятия внутреннего и международного авторитета. Все эти вузы по отдельности были удостоены возможности принять участие в программе «Проект 211» Они внесли заметный вклад в дело экономического и социального развития провинции Чжэцзян, а также всей страны.

В 1998 году вновь происходит объединение вузов (Чжэцзянского университета, Ханчжоуского университета, Чжэцзянского сельскохозяйственного университета и Чжэцзянского медицинского университета) и появляется новый многопрофильный Чжэцзянский университет. С одобрения государственного совета КНР (15 сентября 1998 г.) университет становится одним из центральных элементов реформирования системы высшего образования в КНР. Университет включен в список университетов, принимающих участие в реализации программы «Проект 211» и играющих важнейшую роль в новейшее время.